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Implémentation d’un modèle bio-physique permettant l’estimation de la dose biologique en hadronthérapie avec la plateforme de simulation Monte Carlo GATE.

Postée le 13 jan.

Lieu : Laboratoire de Physique de Clermont UMR 6533 CNRS/IN2P3 - Université Clermont Auvergne Campus Universitaire des Cézeaux 4, avenue Blaise Pascal TSA 60026 CS 60026 63178 - Aubière Cedex FRANCE · Contrat : Stage · Rémunération : A négocier

Société : Laboratoire de Physique de Clermont (LPC), UMR6533 CNRS-IN2P3 Université Clermont Auvergne

Le LPC participe depuis 2002 au développement et à la validation de la plateforme de simulation Monte Carlo GATE basée sur Geant4 pour l’étude de traitements de lutte contre le cancer utilisant des rayonnements ionisants (photons, electrons, protons et ions carbone). Cette plateforme, open source, développée en C++, offre la possibilité de modéliser à la fois les instruments et appareillages d’imagerie utilisés en clinique pour le traitement des cancers chez les patients mais également les interactions des particules avec les tissus.
De manière à être capable de prédire la dose biologique à la tumeur et aux organes à risque en hadronthérapie, des modèles bio-physiques, comme le Microdosimetric Kinetic Model (MKM), combinent, par un algorithme mathématique, des données physiques et des biologiques. Ce modèle, déjà implémenté dans certains logiciels de planifications de traitements, reste à ce jour un modèle de référence pour l’évaluation de l’efficacité biologique des rayonnements. Son implémentation dans la plateforme GATE permettra à une communauté de chercheurs de le comparer aisément à d’autres algorithmes en cours de développement.

Description du poste

Il s’agira d’intégrer le modèle MKM à la plateforme GATE, ce travail nécessitera la création et la modification de classes en C++. Une fois ce travail effectué, l’étudiant devra, en partenariat avec les physiciens, élaborer un benchmark d’intérêt pour le calcul de la dose biologique ; le langage Python pourra notamment être utilisé pour réaliser les analyses de données caractéristiques. Ce travail sera mis à la disposition de la communauté d’utilisateurs (plus de 2000 dans le monde) via GitHub. Cette intégration exigera également la mise en œuvre d’une documentation technique détaillée.
L’étudiant aura à sa disposition un environnement informatique optimal (PC portable, PC de calcul et un accès aux serveurs de calculs du CRRI pour le déploiement de simulation à grande échelle).

Profil recherché

programmation C++ avancée, Python, Git, Linux, DOxygen, bonne pratique de l’anglais

Voir le fichier joint

Pour postuler :

Contacter Mme Lydia Maigne par email ou téléphone:
Lydia.Maigne@clermont.in2p3.fr
Tel: 0473405123