Étude des changements induits par la deutération dans les niveaux d'expression des gènes E. coli

Société : Institut Max Von Laue - Paul Langevin

L'Institut Laue-Langevin, situé à Grenoble au cœur des Alpes, est un centre de recherche international, à la pointe de la science et de la technologie neutroniques. Leader mondial dans son domaine, l'ILL met ses installations et son personnel à la disposition des scientifiques du monde entier

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Description du poste

Depuis plusieurs années, nous travaillons activement à la construction de systèmes modèles de membranes biomimétiques composés de mélanges de phospholipides deutérés extraits et purifiés de la biomasse cellulaire de levure et de bactéries. L'analyse de la composition des acides gras dans les extraits lipidiques de levure a révélé que la deutération induisait une modification du métabolisme des acides gras, provoquant principalement une augmentation significative de la teneur en acide oléique avec une diminution correspondante de la teneur en acide stéarique. De plus, des diminutions significatives de la teneur en acides linoléique et alpha-linolénique ont également été constatées. En revanche, E. coli, une fois adapté à la deutération, a déclenché une diminution majeure de la teneur en acides gras oléiques ainsi qu'une diminution significative de la teneur en acides gras cycliques ainsi que spécifiquement du cyclo-19:0. La synthèse des acides gras est réalisée par l'enzyme « synthase d'acide gras » (FAS) et en aval par une série de réactions catalysées par des élongases et des désaturases. Nous émettons l'hypothèse que les modifications des profils d'acides gras induites par la deutération résultent principalement de modifications des niveaux d'expression des gènes, en particulier ceux impliqués dans le métabolisme des acides gras. Dans ce projet, nous avons l'intention d'utiliser la PCR quantitative en temps réel par transcription inverse (RT-qPCR) qui permettrait de mesurer les niveaux d'ARN grâce à l'utilisation d'ADNc dans une réaction qPCR, permettant ainsi une détection rapide des changements d'expression génique dans E. coli et Pichia pastoris. Le projet consiste à extraire l'ARNm total qui est ensuite transcrit en ADN complémentaire (ADNc). La préparation d'ADNc est ensuite utilisée comme matrice pour la réaction PCR.

Activités du stagiaire
1] Cultivez des cultures de bactéries et de cellules de levure
2] Extraction de l'ARN total et sa conversion en ADNc
3] Préparation du gel d'agarose
4] Réalisation de RT-PCR pour l'analyse de l'expression génique
5] Analyse des données

Profil recherché

Niveau d’études souhaité
BAC + 4/5 en Biochimie, biologie moléculaire

Connaissances linguistiques
Le caractère international de notre centre de recherche nous amène à accorder une attention particulière aux candidatures provenant également d'autres pays que la France. Vous devez être capable de communiquer en anglais ou en français.